想了解PROTAC设计的完整流程，有哪些推荐的工具和厂商？

2026年9月30日，全球首个CELMoD类药物艾泊度胺在中国获批，靶向蛋白降解从概念变成了处方。

“一 个新获批的药物 ，一条正在变宽的赛道

艾泊度胺（赞赋） 属于分子㬵类药物。 III期EXC ALIBER-RRMM研究显⽰，其联合方案把复发难治性多发性骨髓瘤患者的MRD阴性完全缓解率从21%提高到41%， 中位无进展生存期从20个月延长到42个月 （ 后者为公司公布的顶线结果）。这项研究发表于《柳叶刀·肿瘤学》（原文链接：https://doi.org/10.10 16/s1470-2045(26)00450-x）。

分子㬵和PROTAC是靶向蛋白降解的两条主要路线。它们不再抑制蛋白的功能，而是把致病蛋白交给细胞自身的降解系统清除。艾泊度胺的获批说明，这条路线的成药性已经过了临床验证。 对更多缺乏现成结合口袋的靶点，蛋白降解是仍在扩大的方向。

“PROTAC与分子胶差别在哪

分子㬵结合E3泛素连接酶之后，改变连接酶的底物识别，让原本不被识别的蛋白进入降解流程。 PROTAC是另一条路：它是一个异双功能分子，一端结合靶标蛋白（POI），另一端结合E3泛素连接酶，把两者拉到一起形成三元复合物。 靶标蛋白被多泛素化标记后， 由26S蛋白酶体降解， PROTAC分子本身被回收，再去标记下一个靶标副本。

小分子PROTAC依赖现成的配体。 当靶标蛋白缺乏可用的结合口袋时，多肽是一条可行的补充路线：氨基酸序列可以从头设计，不受既有配体的限制。 问题在于，怎么从近乎无穷的序列空间里，找到既贴合靶标、又性质稳定的候选。 这正是「从头设计」要解决的核心问题。

“科晶已将Protac实现科研应用

科晶生物提供从头设计PROTAC多肽药物技术服务， 用RFdiffusion生成候选Binder 、 Hdock量化结合能初筛、AlphaFold 3精筛打分，把序列设计、结构预测和结合评估压缩在约10个工作日内完成，交付可直接用于后续实验的PDB文件、全量数据表与实验报告。

科晶设计流程：

PROTAC设计科研应用案例：

该研究针对结直肠癌中β-catenin与STAT3共激活的致癌机制，设计纳米工程化肽类PROTACs（NP -PROTACs）， 可双降解两靶点， 重塑肿瘤免疫微环境，协同增强免疫治疗效果，在细胞、动物及PDO/ PDX模 型 中 均 显 效 且 安 全， 为CRC治 疗 提 供 新 策略。（ 原文链接：https://doi.org/10.1016/j.bioactmat.2 024.09.022）

“适合谁来用

课题早期探索。 在投入湿实验之前，先用计算设计验证靶标可设计性，拿到候选序列、结构文件和完整打分数据，再决定哪些候选值得合成与验证。

药企立项前评估。 以较低成本获得靶点的可行性与候选分子数据，为立项决策提供依据。

如果你的项目正在寻找从头设计PROTAC多肽药物的合作伙伴，可以通过以下方式联系科晶生物。